隴南市地處西秦嶺東西向褶皺帶發育的隴南山地，秦巴山區、青藏高原、黃土高原三大地形交匯區域，中國地勢第二級階梯向第三級階梯階梯地形的過渡帶。西部向青藏高原北側邊緣的甘南高原過渡，北部向隴中黃土高原過渡，南部向四川盆地過渡，東部與西秦嶺和漢中盆地連線。隴南市地勢西北高、東南低，平均海拔1000公尺，西秦嶺和岷山兩大山系分別從東西兩方伸入全境，境內形成了高山峻嶺與峽谷、盆地相間的復雜地形。
隴南市北部西禮山地呈現低山寬谷的黃土地貌，海拔1800公尺上下；東部徽成盆地介於北秦嶺和南秦嶺之間，長百余千米，寬數十千米，呈現丘陵寬谷地形，海拔1000公尺左右；西南部為高中山與峽谷地，高峻山嶺與深陷河谷錯落相接，對比顯著，相對高差達1000公尺以上。自西北至東南，由大拉梁、岷峨山（海拔3552公尺）等高山經銀洞山（海拔2468公尺）、牛頭山（海拔2224公尺）等中山而至斷頭山（海拔1804公尺）和金子山（海拔1824公尺）等低山，重巒疊嶂，崖壁陡絕，角峰鋸脊，石骨嶙峋。其間河谷幽深狹長，深切曲流十分發育，多急流險灘和瀑布。峽谷中高岸陡崖，峭立如壁。谷旁多狹窄的沖積平原斷續出現，其中武都平原綿長近50千米，寬不過1千米。
隴南市周邊山峰：北為長江黃河分水嶺之大拉梁和岷峨山，東有甘陜邊界的透馬駒山，西有與甘南相鄰的蔥地山，南為甘川分界的摩天嶺。最高峰雄黃山，海拔4187公尺，坐落在文縣西北部的屯寨鄉境內。最低點罐子溝，海拔550公尺，位於文縣東南部的中廟鄉境內，亦為甘肅省海拔最低點。
據【隴南本草綱要】記載，全市共有藥用動植物資源2492種、3856味，分布於332科、1071屬，其中2194個正種、174個變種、109個亞種、15個變型。入典中藥材329種（1995版），居全省中藥材品種資源的首位，是名符其實的「天然藥庫」，素有「千年藥鄉」、「生物基因庫」之美譽。目前已開發利用的有550種，種植品種達80多種，常年收購的主要藥材品種有150種，成為全省主要的藥材生產基地，著名的道地大宗優勢藥材有紅芪、紋黨、當歸、大黃、半夏、柴胡、天麻、山茱萸、黃連、秦艽、羌活、桔梗、板藍根、杜仲、厚樸、五味子、細辛、防風、金銀花、何首烏、五倍子、銀杏、淫洋藿、天南星、黃獨等。
尤其是武都米倉山紅芪、文縣紋黨參、禮縣大黃、宕昌哈達鋪當歸等藥材因品質優良、藥效好而享譽國內外，曾榮獲國家外經貿部【出口商品榮譽證書】，暢銷台灣、香港、東南亞等國家和地區。
