晚明「东林」人员不能说全部是好人，因为「东林」有些是被政敌强加进去的，有些则是「阉党」被崇祯皇帝打压后而自称「东林」者，但总体来说，好人占多数，至于明亡的责任，我们来看看部分「东林」人员在明末崇祯时期的遭遇：
韩爌，内阁首辅，崇祯三年（1630年），被迫去职。
李标，内阁首辅，崇祯三年（1630年），被迫去职。
钱龙锡，内阁辅臣，崇祯三年（1630年），因袁崇焕案牵连被长期关押并遣戍，直到南明弘光时才被释放。
刘鸿训，内阁辅臣，崇祯元年（1628年）被谪戍，后病逝于戍所。
成基命，内阁辅臣，崇祯三年（1630年），被迫去职还乡。
文震孟，崇祯元年（1628年）前，被阉党削职为民，崇祯元年，被任命为皇帝的日讲官。崇祯八年（1635年）七月，升礼部左侍郎兼东阁大学士，入阁预政。没多久被温体仁排挤，落职闲住，于次年病卒。
钱谦益，崇祯元年（1628年），被温体仁排挤，罢职还乡，直到南明弘光时期才被起用。
还有许多被崇祯帝贬谪、罢官甚至被杀的「东林」官员，这里就不一一列举了。
由此可见，崇祯三年（1630年）以后就连最高权力部门——内阁，都已被温体仁、周延儒之流所把持。所以「东林」何以误国？一些小兵小虾能掀起什么风浪？真正掀起风浪的是温体仁、周延儒等为争权夺利而互相倾轧党争，不顾国家安危。
古代「党争」多是朋党之争居多，所谓朋党之争，就是一两个有权有势的人起头组成一个政治利益团体，跟另一个有权有势的人起头，组成的政治利益团体相互争权夺利，这便是古代「党争」。「东林」实权派在崇祯三年后已纷纷去位，根本掀不起风浪。
况且许多「东林」人士过于耿直耻于用那样的手段，以至更不受崇祯皇帝的欢迎，崇祯皇帝喜欢的是能顺从他想法的人。
在清军入关后，不少「东林」人士或起而抗争、或殉节而死，当然也有部分降清。
清朝乾隆皇帝抹黑「东林」人士说
「不能守祖业，徒以国亡殉节为有光，有是理乎？」
这句话看起来很有道理，但实际情况却不是如此，打仗这个事，不是一朝一夕能练就的，古来名将无不是经历许多次战役而成就的。
一个读书人、一个文官，第一个要解决的是手下要有兵，也就是要先练好兵；再次则是要不断去与敌人战斗、不断磨炼，才能打造出「来之能战，战之能胜」的部队。
戚继光练兵都费了好一段时间呢。一个读书人、一个文官手中无兵情况下如何与对方几十万人争斗？那末不愿投降，只能殉节了。
许多人就会问，那当时军队掌握在谁手里？答案是军阀。比如南明「四镇」，可南明「四镇」，文官史可法根本调不动他们，磨破嘴皮，才答应彼此合作。最后的结局是南明「四镇」两镇降清，一镇被汉奸设计杀害，一镇抗清战死。史可法也战亡。
也有许多读书人文官组织了许多民众抗清，但没有充足的时间将兵练好，终究比不上那些军阀自己有军队。所以南明灭亡真正该反思的是这些军阀和奸臣、还有皇帝。
那么，清朝为什么要抹黑「东林」呢？个人总结了以下几点原因：
1、钳制言论，尤其要压制汉人言论，因为「东林」是最主张言论自由的，那清朝把「东林」抹黑后、「东林」名声被搞臭后，一些人听信谣言，就不再学「东林」去发表议论了，即使有不公，也麻木不仁，当作没看到。
2、抹黑抗清志士。
