南京花神廟擁有悠久而迷人的歷史故事，其起源可以追溯到明代。
1.據傳，在明朝初期，當朱元璋定都南京後，為了滿足皇宮對鮮花的需求，希望一年四季都有鮮花裝扮皇宮，他下令尋找一個適合培育各種花卉的地方。最終，城南中華門外約兩公裏多的丘陵地帶因其得天獨厚的土質、氣候和地勢條件被選中，成為專門為皇室培植名貴花卉的基地。這個地方逐漸發展成為一個繁榮的花卉培育中心，為皇室供應各種珍稀花卉，極盡一時之盛。
2.隨著時間的推移，這個區域逐漸形成村落，並在清代乾隆年間正式建成了花神廟。花神廟不僅是村民祭祀花神，祈求花木繁茂、收成良好的場所，也成為了當地花卉文化和傳統的重要象征。廟內供奉著數尊花神塑像，反映了古代中國人對自然界的崇拜和對農業生產的重視。
花神廟的舊址如今已不可尋，有說花神廟舊址在花神廟小學旁邊，具體不得而知。
3.花神廟村的名字由此而來，它不僅僅是對一個宗教建築的稱呼，也是對整個地區的泛稱，代表了這一帶悠久的花卉種植歷史和深厚的文化底蘊。到了現代，花神廟及其周邊地區如紫荊花路、郁金香路等，依然保留著與花卉相關的地名，成為南京著名的文化地標和旅遊景點。
4.每年春季，花神廟地區會舉辦各類花卉展覽和慶祝活動，如「桃花會」，這樣的傳統活動不僅展示了花神廟豐富的花卉資源，也讓人們能夠體驗到傳統文化的魅力，感受與自然和諧共存的美好願景。
