新中國建立後，毛澤東作為全黨領袖和全軍統帥，對於組織紀律性和請示報告制度極為重視。他多次對無視中央權威、不及時請示報告的行為提出了嚴厲批評，發揮了良好的警示作用。
具體而言，1949年10月19日，毛澤東親自點將，任命羅瑞卿為公安部長。羅瑞卿上任後，致力於加強北京治安工作，迅速使整個城市煥然一新。毛澤東對他的表現給予高度評價，贊揚道：「有你羅長子在，就有黨中央的安全在，我就可以睡好覺、吃好飯。」
盡管羅瑞卿在保衛工作上付出了極大努力，但在1950年9月的一次工作匯報中，毛澤東還是向他發火。在會面中，毛澤東詢問羅瑞卿為何未直接向他報告公安部的相關事務，質問：「羅長子，羅部長，你是我親自選調進京的，公安部的一些事情，為什麽不給我寫報告？」
羅瑞卿立即解釋道：「我確實寫過報告，而且不止一次。」
毛澤東更為嚴厲地追問：「寫了？拿我的收條來！」
羅瑞卿茫然回應：「報告都是呈總理，再轉主席這裏的。」
毛澤東的語氣稍緩：「報告今後要直接送給我。現在你那裏有些什麽檔？可以拿來我看看。」
羅瑞卿遂將隨身攜帶的經濟保衛工作會議檔呈給毛澤東，毛澤東在檔上做出批示，強調保衛工作必須特別強調黨的領導作用，並在實際操作中受到黨委的直接領導，否則將存在危險。
羅瑞卿告別後，秘書李銀橋向毛澤東詢問：「主席，您為何對羅部長如此嚴厲？我看他都被嚇得滿頭大汗了！」
毛澤東笑著回答：「銀橋，我告訴你，像羅長子這樣直接從野戰軍調上來的人，必須受到一些關註，不能輕視。你得知道，公安部在國家體系中占據著關鍵的地位，必須始終置於黨中央的堅強領導之下，否則就存在一定的危險。」
羅瑞卿也深感毛澤東的指示至關重要，他迅速傳達給全國公安機關，並開始更加密切地向毛澤東請示和報告工作。
隨著新中國的建立，聶榮臻被任命為代總參謀長。為了分擔毛澤東的工作負擔，他對總參作戰部部長張震說：「毛主席他們的事務太繁忙，你們報告的事情細枝末節都交給我處理吧。需要毛主席知道的，我會審批後再報告。」
經過聶榮臻的交代，總參直接向毛澤東呈報的檔顯著減少。毛澤東對此頗感不滿，在一次軍委會議上批評道：「最近，我感覺工農青婦的問題擺得滿桌，都吃不完。但是，軍隊系統的問題卻太少了，我感到饑餓！」
不久後，毛澤東再次找聶榮臻批評，原因是一份重要的電報尚未被他看到，總參卻已以軍委的名義發了。毛澤東嚴厲地責備聶榮臻：「以後不得越權，凡是以軍委名義發的電報，必須先送給我審閱後再發。」
實際上，這份電報是軍委辦公廳主任張經武以軍委名義下發的，而聶榮臻成了替罪羊。然而，在此次事件之後，聶榮臻更加註重呈送檔的程式，要求身邊工作人員當天處理完當天的事務，尤其是呈送給毛澤東的電報，必須盡快轉譯出來。
1960年，毛澤東對中央和地方自負盈虧、我行我素的現象感到越來越無法容忍。他認為這種狀況嚴重阻礙了黨和國家事業的發展。在1964年12月27日的中央工作會議上，董必武提出了一個引起毛澤東高度共鳴的觀點：「現在縣以上幹部應該定期調換，過去封建王朝就是3年一輪換。」
毛澤東對此深感認同，並在會上表達了對當前情況的不滿，直言道：
「現在已經過去了15年，卻依然存在獨立王國的情況。在北京，我所指並非北京市委，而是存在兩個獨立王國，至於是哪兩個，你們去猜吧，我就不明說了！」
盡管毛澤東在當時並未點名具體機構，但後來吳冷西回憶，在一次人數較少的常委會上，毛澤東明確指出這兩個「獨立王國」分別是中央書記處和國家計委。
為什麽毛澤東如此強調請示報告的重要性呢？這是因為在他看來，加強請示報告、實行集中統一領導，對於中國這樣一個龐大的國家以及中共這樣一個大黨，是確保組織和制度的正確運轉的必要條件。毛澤東深知，以他為核心的黨的第一代領導，正是在集體的堅強領導下，才能夠引導人民群眾建立新中國，過上美好生活。因此，他對請示報告的強調在當時乃至今天仍然具有深刻的現實意義。
