何無忌奉帝東歸，安帝乃自江陵啟鑾，還至建康
桓玄至江陵，收集荊州兵，有眾二萬，復挾晉安帝東下。行抵崢嶸洲，正值劉毅各軍揚帆前來。劉道規望桓玄船麾眾先進，劉毅、何無忌，鼓棹隨行。此時正是仲夏天氣，西南風吹得甚勁，劉道規乘風縱火，劉毅等亦助薪揚威，燒得長江上下，煙霧迷濛。桓玄所督領諸戰艦，多半被焚，部卒大亂。桓玄慌忙改乘小舟，仍將晉安帝挾去遁還江陵。
部將殷仲文叛桓玄降劉裕，奉晉二後還京。桓玄再返江陵，人情離叛，沒奈何乘夜出奔，欲往漢中。南郡太守王騰之，荊州別駕王康產，奉晉安帝入南郡府，尋遷江陵。
益州刺史毛璩有侄毛修之，為桓玄屯騎校尉，誘桓玄入蜀。桓玄依言西行，至枚回洲，適上流來了喪船數艘，船首立著一員衛弁，與毛修之打了一個照面，便厲聲呼道：「來船中有無逆賊？」毛修之不答，桓玄卻顫聲說道：「我是當今新天子，何處盜賊，敢來妄言！」此時還想稱帝，太不自量。道言未絕，那對船上又跳出二將，拈弓搭矢，飛射過來，桓玄嬖人萬蓋、丁仙期，挺身蔽桓玄，俱被射倒。桓玄正在驚惶，突有數人持刀躍入，為首的正是對船衛弁。便駭問道：「汝等何人？敢犯天子！」衛弁即應聲道：「我等來殺天子的賊臣！」說至此，即用刀劈桓玄，光芒一閃，桓玄之首分離。衛弁為誰？原來是益州督護馮遷。
益州毛璩有弟毛璠為寧州刺史，在任病歿。毛璩派兄孫毛祐之及參軍費恬，扶櫬歸葬，並派馮遷護喪。恰巧中流遇著桓玄之船，由毛修之傳遞眼色，便一齊動手，殺死賊玄。不必細問，就可知對船發矢的二將，便是費恬、毛祐之了。馮遷既梟桓玄之首，執住桓玄之子桓升，殺死玄族桓石康、桓浚，令毛修之賫獻桓玄首級及檻解桓升，馳詣江陵。晉安帝封毛修之為驍騎將軍，誅桓升東市，下詔大赦，惟桓氏不原。
桓玄侄子桓振，逃匿華容浦中，招聚黨徒，得數千人，探得劉毅等退屯尋陽，即襲擊江陵城。桓謙亦匿居沮川，糾眾應桓振。江陵城內只有王騰之、王康產二人守著，士卒無多，徑被兩桓掩入。王騰之、王康產戰死。晉安帝尚寓居江陵行宮，桓振持刀進見，意欲行弒。還是桓謙馳入勸阻，方才罷手，下拜而出。為桓玄舉哀發喪，桓謙率百官朝謁晉安帝，奉還璽綬，所有侍禦左右，一律撤換，改用兩桓之黨羽，乘勢攻取襄陽等城。
劉毅等還居尋陽，總道是元兇就戮逆焰消除，可以高枕無憂，哪知死灰復燃，復有兩桓余孽，襲取江陵。急忙令何無忌、劉道規二將進討兩桓。師至馬頭，已由桓謙派兵扼住。兩下裏殺了一場，桓謙眾敗退。何無忌、劉道規直趨江陵。桓振令黨徒馮該設伏楊林，自率眾逆戰靈溪，何無忌恃勝輕進，被賊軍兩路殺出，沖斷陣勢，大敗奔還。幸虧劉敬宣聚糧繕船，接濟何無忌、劉道規，復得成軍，蹶而復振。
劉敬宣即劉牢之子，前時逃往山陽，擬募兵討桓玄，未克如願。再往南燕乞師，南燕主慕容德不肯發兵。劉敬宣潛結青州大族，及鮮卑豪酋，謀襲燕都，事泄還南。時桓玄已敗死，走歸劉裕，劉裕令為晉陵太守，尋又遷授江州刺史。他因劉毅等討桓玄余黨，所以籌備舟械，隨時接應。
何無忌、劉道規得此一助，再進兵夏口。劉毅亦督軍隨進，攻入魯城。劉道規亦拔偃月壘，復會師進克巴陵。號令嚴整沿途無犯，再鼓眾至馬頭。桓振挾安帝出屯江津，遣使請和，求割江、荊二州，奉還天子。以皇帝為交換品，卻是奇聞。劉毅等不許。會南陽太守魯宗之起兵襲襄陽，桓振還軍與戰，留桓謙、馮該守江陵。桓謙遣馮該守豫章口，為劉毅等擊敗，桓謙棄城遁走。劉毅等馳入江陵，擒住逆黨卞範之等，一並梟斬。
晉安帝當時在江陵，未被桓振挾去。劉毅得入行宮謁帝，由帝面加慰勞，一切處置，悉歸劉毅主持。劉毅正擬追剿兩桓，適桓振回救江陵，在途聞城已失守，眾皆駭散，桓振亦只好逃匿涢州。既而召集散眾，復襲江陵，為將軍劉懷肅所聞，伏兵邀擊，一鼓誅桓振。桓振為桓氏後起悍將，至此斃命，桓氏遺孽垂盡，惟桓謙等奔入後秦。
晉安帝改元義熙（公元405年）。再下赦書，除桓謙等不赦外獨赦桓沖之孫桓胤，徙居新安，令存桓沖宗祀，保全功臣一脈。桓沖系桓玄叔父，有功晉室，封豐城公。劉裕聞報，使劉毅、劉道規留屯夏口，命何無忌奉帝東歸。安帝乃自江陵啟鑾，還至建康。百官詣闕待罪，有詔令一並復職。授瑯琊王司馬德文為大司馬，武陵王司馬遵為太保，且封賞功臣，首劉裕，次及劉毅、何無忌、劉道規。詔敕有雲：
朕以寡昧，遭家不造，越自遘閔，屬當屯極。逆臣桓玄，垂釁縱慝，窮兇恣虐，滔天猾夏，誣罔神人，肆其篡亂，祖宗之基既湮，七廟之饗胥殄，若墜淵谷，未足斯譬。皇度有晉，天縱英哲，都督揚、徐、兗、豫、青、冀、幽、並、江九州諸軍事鎮軍將軍徐、青二州刺史劉裕，忠誠天亮，神武命世，用能貞明協契，義夫向臻，故順聲一唱，二溟卷波，英風振路，宸居清翳。冠軍將軍劉毅，輔國將軍何無忌，振武將軍劉道規，舟旗遄邁，而元兇傳首，回戈疊揮，則荊漢霧廓。俾宣元之祚，永固於嵩岱，傾基重造，再集於朕躬。宗廟歆七百之祐，皇基融載新之命。念功惟德，永言銘懷，固已道冠開辟，獨絕終古，書契以來，未之前聞矣。雖則功高靡尚，理至難文，而崇庸命德，哲王攸先者，將以弘道制治，深關盛衰，故伊望膺殊命之錫，桓文饗備物之禮，況宏征不世，顧邈百代者，宜極名器之隆，以光大國之盛。而鎮軍謙虛自衷，誠旨屢顯，朕重逆仲父，乃所以愈彰德美也。鎮軍可進位侍中車騎將軍都督中外諸軍事，使持節徐、青二州刺史如故。顯祚大邦，啟茲疆宇，特此詔聞！
這詔下後，劉裕上表固辭。再加錄尚書事，劉裕又不受，且乞請歸藩。晉安帝不允，遣百僚敦勸，劉裕仍然固讓，入朝陳情，願就外鎮，乃改授劉裕都督荊、司、梁、益、寧、雍、涼七州，並前十六州諸軍事，仍守本官，劉裕始受命，還鎮丹徒。封劉毅為左將軍，何無忌為右將軍，分督豫州、揚州軍事，劉道規為輔國將軍，督淮北諸軍事。余如並州刺史魏詠之以下，皆加官進爵有差。
（本篇完）
