1959年對彭老總來說是人生的一個重要轉折點，在此之前他是國防部長，主管軍委事務，且有率部打贏抗美援朝之功，風頭、威望都一時無二。
但在一場會議之後，他就失去了軍職，處境也變得尷尬，雖然還是國務院副總理及政治局委員，但郁悶之下，他不願去參加會議，深居家中數年。
那場會議影響到的不僅僅是他，開國將軍裏還有五人也被下放，分別是大將黃克誠、上將鄧華、上將洪學智、中將萬毅、少將鐘偉。
這五人中，萬毅的經歷比較特殊，他並非紅軍，加入革命的時間比較晚，與彭老總的淵源也沒其他四人深，然而後來他身體遭受的傷害卻是最大，實在令人唏噓。等到復出工作時，他沒有想別的，只對鄧公提了一個請求，可見他的赤心。
萬毅出身於東北軍，在張學良麾下戰鬥過多年，1942年末他加入了八路軍堅定抗日，到解放戰爭時期就主要在東北戰鬥。
客觀來說，東北軍的軍事現代化是要走在紅軍前面的，早在張作霖時期，他們就引進了不少工業器材，並且有飛機、大炮，很多軍官還接受過系統性的軍事教育。萬毅就是一個有豐富科班經驗和知識的將領。
在當時的我軍之中，這屬於稀缺人才，所以在四野南下之際，萬毅擔任了中南軍區炮兵司令部司令員。後來的抗美援朝時期，彭老總是誌願軍司令員，萬毅是誌願軍炮兵司令員，不過兩人接觸的時間也不久，萬毅參加了兩次戰役，很快奉命回國。
黃克誠、鐘偉是紅三軍團出來的人，鄧華、洪學智是誌願軍第一、第二副司令員，相比較起來，別人不怎麽會把萬毅看成是彭老總的人，所以萬毅敢支持彭總更顯得難能可貴。
不過真要說起來，萬毅也不是支持彭老總個人，只是支持自己認為正確的事。萬毅是一名純粹的軍人，他並不喜歡那些會議。
比如1958年彭老總批粟裕，他也認為不好。當時萬毅是總參謀部裝備計劃部部長，屬於粟裕的下級，所以有人想讓他出來說說粟裕工作上的問題。萬毅覺得粟裕並沒有大過錯，就一直沈默以對。
1959年的會議他本來級別不夠，不用參加，只是當時正值中蘇關系微妙之際，蘇聯對一些工業專案的援助進行了變動，萬毅需要及時向國防部長彭老總、國防科委主任及時匯報，於是他就上山了。
他怎麽也沒想到，在極短的時間內，局勢已經天翻地覆。
那場會議分為兩部份，第一部份是傳達會議精神，只是在彭老總上了「意見書」後，就進入了以批評為主的第二部份，參會人數也持續增多，形成了小組討論和大會批判相結的情況。
小組以大軍區、兵種、任職部門等劃定，總參謀部和軍委辦公廳在一個小組，萬毅被安排成了組長。從這裏可以看出當時組織是沒有把萬毅和彭老總相聯系的，只要他隨便搞點材料就能含糊過去，但他沒有這樣做。
其他大部份小組的討論都熱火朝天，萬毅這個小組卻兩三天沒什麽人發言，氣氛非常緊張。有領導認為這樣不行，就向萬毅施加了壓力。於是，在下一次小組討論會上萬毅開了口：既然大會要我們揭發批判，我們倒不如認真把彭德懷的‘意見書’學習學習，討論討論。
此話一出在場人都有些驚訝，因為當時主題已經不是‘意見書’，而是批人了，萬毅這樣說，有些不符合整體基調。
有萬毅先開了口，小組內的其他同誌你一言我一語就說開了，最終他們得出一個結論：彭老總反映的很多事情都是客觀存在的。萬毅見此就說：看來大家都有了答案，就沒有什麽可批了，我作為組長，宣布小組解散，大家分頭自學。
這個舉動著實大膽，所以有好友就說「你這樣會惹麻煩的」，萬毅則回道：什麽麻煩？他們才是真正找麻煩呢！
事實正如好友所料，萬毅很快也被認為是「軍事俱樂部」中的一員，撤銷了職務，次年轉到了山西工作，長期負責林業。他沒有被眼前的困難打倒，依然嚴格要求自己，雖然先前沒有類似的工作經驗，但他一邊學習一邊到基層做調研，還是做出了不小的貢獻。
1967年，萬毅受到沖擊，失去了人身自由，直到1973年才被釋放。
因為戰爭年代受過傷，那幾年處境又比較糟糕，導致萬毅左眼失明，右眼也有很嚴重的青光眼。被釋放後，本來他可以回陜西工作，但身體已經不允許，就留在北京治療。可惜此時也有些晚了，沒能把那只眼睛徹底治好。
1977年，萬毅得到平反，組織想要給他一些優待，讓他提要求，上面會盡可能滿足。萬毅只有一個想法，希望能重新回到軍隊工作。
復出工作不久的鄧公聽後很感慨，說這些老同誌都不抱怨個人的遭遇，就是一直放不下軍隊建設，真正的大公無私。
不久後，中央安排萬毅擔任解放軍總後勤部顧問，雖只是顧問，萬毅也非常開心，1978年身體恢復一些就迫不及待地去後勤部報到。雖然他年紀大了，但還是很有熱情和幹勁。
1984年萬毅眼疾惡化，自知無法繼續工作的他不久後主動辭去了身上的職務，晚年享受了正大軍區職待遇，自至1997年病逝。
在開國將帥中，萬毅還有段獨一無二的經歷——參加過南京保衛戰，當時他是東北軍57軍112師672團團長，率部與日寇血戰，最終全團只剩下五個人還活著，相當慘烈。
加入八路軍後，萬毅打擊日寇也極為用命，在蘇魯地區日偽據點中流傳著這樣一句話「不怕一萬，就怕萬毅」，可見將軍當年的風采。
只可惜在年富力強的時期，萬毅卻受到牽連失去了軍職，不管對他還是對軍隊來說，這都是一大遺憾。
