赤松德赞在794年去世，之后他的两个儿子先后继位，但在位时间都比较短。816年，赤松德赞的孙子——赤祖德赞继承赞普大位。
赤祖德赞被藏传佛教称为「护教大法王」，是他确立了 七户养僧制 ——即每七户农奴供养一个僧人。这一制度使得密教在吐蕃获得野蛮生长。吐蕃是奴隶制社会，没有自耕农，所有的农民都是农奴，他们没有自己的土地，也没有独立的人格，在身份上分别隶属于不同的庄园主。他们平时为庄园主耕种土地，战时则参军为主人而战。
赤祖德赞给每个寺院分配了土地和一定数量的农奴。这些土地和农奴就成寺院的固定资产。农奴耕种土地和放牧，供养寺院生活所需，以便僧人们能专心致至地钻研佛法。
为了体现僧人的崇高地位，赤松德赞颁布了严苛的法令：
凡是以手指指向僧人的，一律斩断手指。
凡是以带着恶意的眼光直视僧人的，一律挖目。
……
这些严苛的法令，不仅仅是针对农奴的，也针对苯教徒和普通官员。因而激起了他们强烈的反佛情绪。赤祖德赞则以暴力实施镇压。
赤松德赞这一举措严重打击了苯教，苯教gui族的权力被收归到了王室。苯教被迫与密教妥协，两教逐渐合融为一。导致流传至今的藏密中包含了很多苯教的东西。
但究竟哪些东西是密教固有的，哪些是苯教带进来的？这其实是个非常复杂的问题。以人肉祭祀为例，有人说是苯教带进来的，但也有人说这是印度密教原本就有的陋习。一些密教宗派用嘎巴拉做祭祀。所谓的「嘎巴拉」就是人的头盖骨。还有用人的内脏祭祀鬼神的。有一种像鼓的法器，鼓面是用整张人皮做的，名叫「辛且央西」。总之非常血腥。
这些东西这究竟是不是苯教带入的呢？其实用人肉血祭在上古时代各民族中非常普遍。中国商朝就非常盛行人祭，在西周时才改为陶俑。古印度也曾盛行人祭。所谓的「荼毗」其实就源自上古的人祭，将死者的尸体烧掉，据说这是在祭天，能够抵销死者生前的一切罪业。印度密教向来就有人肉祭的传统，在金刚乘密教史上很普遍，当然现在是没有了。所以，将藏传佛教史上的人肉血祭统统归到苯教身上未必准确。
但无论怎么样，人肉血祭遭到了吐蕃民众的强烈反对，特别是底层民众，因为用作牺牲的对象通常是他们。
在赤祖德赞的崇佛法令下，不少gui族被挖去了眼睛，这引起了他们对赤祖德赞的極大愤怒。一场针对他的谋杀行动秘密展开。公元838年，赤祖德赞在墨竹视察时，当地的官员向他敬献了美女和美酒，他高兴之下喝多了葡萄酒，醉倒在了宴会上，大臣韦·甲多热 用绳子套在赤祖德赞的脖子上，将他活活勒死。
赤祖德赞死后，他的兄弟朗达玛继位。朗达玛（799-842年）在欧阳修的【新唐书】称之为「达磨」。他在位期间，反密教势力控制了朝政大权，展开了为期四年的「朗达玛灭佛」运动。
朗达玛下令关闭吐蕃境内所有的佛教寺院，包括大昭寺、小昭寺、桑耶寺在内的所有寺庙，不是被拆毁，就是用泥土封起来，寺里的金属佛像被融掉或埋进土里，泥像则被捣毁，佛经全部烧毁，高級僧侣全部被杀，中级僧侣全部流放，低级僧侣勒令全部还俗。
这次灭佛运动只进行了四年时间，但对密教的打击非常重，使密教在吐蕃沉寂了两百多年。
但是，在公元842年，也就是灭佛运动的第四年。朗达玛在外出巡视时，被密教僧人白吉多杰一箭射死。白吉多杰当场自杀，所以到底是谁策划了这场政变无从查起，或许只是白吉多杰的自发行动，他这是在为宗教献身。
朗达玛去世后，吐蕃发生了分裂。他的两个儿子永丹、斡松分别成立了两个政权，之后又进一步分裂，此后再也没有出现过统一的吐蕃政权。密教也分裂成了不同的宗派，分别与各地的世俗政权结合。
