在抗战结束后，1945年，秦基伟接替李达担任太行军区司令员，太行军区与太岳军区、冀南军区、冀鲁豫军区一起隶属于晋冀鲁豫军区。
此外，还成立了1纵、2纵、3纵、4纵和后来的6纵。
在解放战争初期，秦基伟作为二级军区的军政主官，负责后方建设。虽然他在土地革命和抗日战争时期有着可圈可点的战绩，但在这些时期他的表现并没有达到能够评级为准兵团级的标准。
直到1952年评级时，他只是被评定为正军级。不过，这并不影响他在解放战争中的重要地位。在解放战争中，他和陈赓、陈锡联、陈再道、王近山等平级的野战纵队军政主官一起，负责前线作战。
虽然他没有在主力部队参加过抗战时期之初的诸多战役，但在1940年调任冀南担任主力旅副旅长后，他参加了百团大战，并担任了太行军区第一分区司令员。
抗战结束后，他担任太行司令员，与陈赓一样担此重任，并比王近山、杜义德更早一步晋升为纵队级正职。此时，杜义德仅是冀南军区副司令，而王近山仍是6纵副司令员。
王近山、杜义德指挥的6纵在定陶战役、豫北战役、鲁西南战役中取得连战连捷，功勋卓著。相较于他们，秦基伟主要负责地方支援和协同作战。
1947年8月，太行军区部队提升为9纵，他也成为9纵司令员。然而，这支部队的战斗力稍显薄弱，更多是负责配合其他主力部队。
直到1949年渡江战役后，在陈赓的指挥下，9纵在豫西根据地展开了激烈战斗，与地方部队交锋，参与小规模战斗以及配合4纵进行攻坚战，逐步崭露头角。
秦基伟的战功虽然相比陈赓、陈锡联、王近山和杜义德稍逊一筹，但这并不影响他在上甘岭战役中的出色表现，这场战役发生在1952年10月。
值得一提的是，1952年的军衔评定并不是只看在解放战争中的职务，而是根据此前担任的职务以及资历、综合职务和战绩等多方面因素进行评定的。
例如，莫文骅、李天焕、郭化若、韦国清和张震都曾担任正兵团职务，但评为了副兵团级。
「准兵团级」是一个独特且极具挑战性的级别。这个级别的评定需要参考干部的资历、战绩以及历任职务，最终评选出的53位准兵团级干部，其中有些人虽然战绩不是最高，但是他们的历任职务却是非常高，如孙毅。
他在1932年就担任师参谋长，并且在抗战师还当过晋察冀军区参谋长，解放战争期间长期担任冀中军区司令。 尽管秦基伟担任纵队级首长的时间早，但是相比他的三个时期综合战绩来说，还是偏少。
然而，他仍然被评为正军级，这是完全合理的。这再次证明，评定准兵团级需要全面考虑干部的各个方面，而不仅仅是单一的战绩。
