中央紅軍長征後，蔣介石為鞏固對中央蘇區的占領，於1934年12月撤銷「圍剿」中央蘇區的國民黨軍各路軍的序列，對江西、福建實行「綏靖」部署，委派蔣鼎文為駐閩綏靖主任，將福建劃為4個綏靖區。
閩西列為第十綏靖區，以衛立煌、李默庵為正副司令官，指揮8個正規師和地方反動武裝，對閩西紅軍遊擊隊發起連續的「清剿」。
第十綏靖區部隊聯合江西邊境的「清剿」部隊進行「會剿」，從會昌、武平、長汀四面對福建省委駐地——長汀四都山區完成了包圍。
這時，福建省軍區直屬的紅軍主力第十九、二十團及地方武裝還有4000余人，如果指揮得當，還是能在遊擊戰爭中發揮巨大作用的。
可惜的是福建省委、省軍區領導人萬永誠依然集中部隊搞大兵團作戰，強使處於絕對劣勢的四千紅軍，正面對抗八個師的蔣軍強敵，打毫無勝利希望的陣地戰。
按萬永誠的部署，紅軍全部集中在長汀四都一帶狹小的地區內，準備同前來圍攻的敵人決戰，以「保衛蘇區」。
當年4月，包圍圈逐漸縮小。困守四都山區的紅軍部隊補給日益困難，糧食藥品匱乏，傷病員日增，處境極端惡化。
萬永誠被迫決定部隊分三路突圍。但為時已晚，在敵眾我寡的重重圍困中，突圍部隊均遭失敗。萬永誠和上千名紅軍戰士於1935年4月底犧牲在四都山區。
不過，閩西鬥爭還是留下了種子。1934年12月，張鼎丞奉蘇區中央分局的命令潛回長汀四都山區，擔任福建省蘇維埃主席，指導當地遊擊戰爭。
張鼎丞見到省委書記萬永誠後，向他建議趕緊分散力量打遊擊，他拒不接受。於是，張鼎丞毅然提出自己要回龍巖、永定、上杭地區去堅持遊擊戰爭，萬永誠不能不同意。
回到永定後，張鼎丞即以老根據地永定溪南為中心，著手進行杭永巖遊擊戰爭的組織工作，把較有戰鬥力的紅八團、紅九團和明光獨立營等部隊組織了起來。
與此同時，困守在寧都、於都邊境仁風山區的中央分局和紅軍部隊的處境也日益困難。項英在嚴重的形勢面前，決定領導機關只留下項英、陳毅、賀昌3人，其余分局委員立即分路突圍，到各地領導遊擊戰爭。
中央分局委員陳潭秋和譚震林率領紅二十四師1個主力營向閩西方向突圍，準備同在永定的張鼎丞匯合。
隨後，瞿秋白、何叔衡、鄧子恢等先後分路向閩西方向突圍。
鄧子恢一行途經小徑村時，被國軍保安十四團襲擊，何叔衡壯烈犧牲，瞿秋白被捕，之後於長汀英勇就義。只有鄧子恢成功脫險，重返福建省委駐地四都山區，碰巧找到了陳潭秋、譚震林一行。
於是，鄧子恢和福建省蘇維埃政府秘書長溫仰春一起，隨同這支部隊出發，又一次踏上了返回閩西的征途。於1935年4月8日在永定與紅八團會師。
1935年4月12日，陳潭秋以中央分局代表的名義，在永定縣赤寨一個斷墻殘壁的瓦窯裏，主持召開了閩西南黨政軍領導幹部聯席會議。
會議決定成立閩西南軍政委員會，作出各部隊分散獨立作戰的部署，將閩西南地區劃分為三個作戰分區：
第一作戰分區，以紅九團第二營和明光獨立營組成，羅忠毅任司令員，方方任政委，在龍巖、連城、寧洋三縣邊界地區活動。
第二作戰分區，由紅九團第一、三營和永東遊擊隊組成，吳勝任司令員，謝育才任政委，開辟永定、平胡以及廣東大埔、饒平等縣邊區，打通與閩南紅三團的聯系。
第三作戰分區，由紅八團和龍巖遊擊隊組成，邱金聲任司令員，邱織雲任政委，在龍巖、南靖，漳平三縣活動。
紅二十四師主力營100多人、卓林大隊以及永定、上杭、新汀杭等縣獨立營，由軍政委委員會直接領導，在永定、上杭地區活動。
從此，閩西地區的遊擊戰爭全面地開展起來。
國民黨軍隊占領閩西蘇區後，進行了瘋狂的報復，從1935年5月起，至1937年9月，在兩年零四個月的時間內發動了5次大規模的「清剿」，小範圍的「清剿」則數不勝數。
國民黨軍「清剿」初期以軍事進攻為主，依仗其軍事上的絕對優勢，采取分進合擊，層層包圍的戰術，「清剿」、「駐剿」、「搜剿」並用，揚言在3 個月內消滅閩西紅軍遊擊隊。
為了達到徹底摧垮紅軍遊擊隊的目的，他們提出「以十換一，就是勝利」的口號，與紅軍拼消耗，他們還強迫群眾在所有村鎮和交通要道修公路築碉堡，以扼制紅軍遊擊隊的活動。
紅軍遊擊隊稍有不慎，即使留下一個腳印或者一片菜葉，都有可能招致不測。
但是，不管國民黨軍的「清剿」計劃如何險惡，手段如何殘酷，也嚇不倒紅軍遊擊健兒，他們在閩西南軍政委員會領導下，緊密依靠群眾，在各遊擊區域頑強戰鬥，廣泛開展遊擊戰爭。
1935年5月，第一作戰分區司令員羅忠毅和政治委員方方，率領明光獨立營從永定重返龍巖、連城、寧洋邊區，會合了留在那裏由劉漢率領的紅九團第二營，以及突圍出來的閩贛軍區第十七、十八團部份人員，相機開辟新的遊擊根據地。
巖連寧邊區山高林密，土匪如麻，紅軍遊擊隊要建立遊擊根據地就應對土匪采取相應的政策。於是方方提出：在土匪不受國民軍收編、不抽收據點內群眾保護費、不侮辱婦女的前提下，應與土匪訂立互不侵犯的條約，並在與土匪接觸中逐漸教育爭取其為人民做好事。
根據這一原則，各小分隊積極進行爭取與改造土匪的工作，取得了明顯的效果，在這一地區站住了腳跟。
第二作戰分區司令員吳勝、政委謝育才率領紅九團第一、三營從永定南下，經廣東大埔轉入閩南平胡縣境，為了擺脫敵人的追襲，紅九團不斷變換行軍方向，夜行晝宿，於6月底到達平胡縣三坪，與閩南紅三團勝利會師。
這時，國民黨在閩粵邊境集中了第八十師和廣東方面的獨立第—師、第九師，分別向閩粵邊各縣紅軍遊擊隊進攻。
紅九團立即與紅三團分開行動，在永定、平胡、南靖、大埔、饒平諸縣邊界展開遊擊戰爭。
紅九團勇猛善戰，在短短幾個月內消滅了許多反動據點，擴大了影響，並武裝群眾，組建地方遊擊隊。
7月，紅九團在廣東饒平擊潰粵軍李漢槐部1個營，在平胡縣犀牛崗擊潰第八十師1個團；8月間，又消滅坪回民團，並在大蘆溪擊潰「清剿」之敵的數路進攻，這些戰鬥的勝利，震動了閩粵邊境的敵人。
以紅八團為主體組成的第三作戰分區，由政委邱織雲、參謀長王勝率領團部及第一、三、五連向漳龍公路兩側地區活動。
政治部主任伍洪祥帶領第二、四連為掩護團部行動，秘密潛入龍巖以北，與縣遊擊大隊會合，然後穿越龍巖至長汀的公路，到達紫金山。
國民黨軍發覺這一行動，立即調集大部隊包圍了紫金山，伍洪祥率部選擇敵重兵駐守而容易麻痹的地方作為突破口，乘著夜色奮力沖殺，突破重圍，擺脫追擊，與團部勝利會師。
紅八團和紅九團由於與地方黨和群眾關系密切，熟悉地方情況，又善於運用遊擊戰術，破壞交通，襲擊機場，拔除據點，搞得國民黨軍寢食不安。
國民黨雖然在軍事上占絕對優勢，但由於得不到群眾的支持，處處受到紅軍遊擊隊的襲擊。國民黨以軍事進攻為主的「清剿」，只得以失敗而告終。
一計不成又生一計。1935年12月，國民黨軍改變「集中兵力，分進合擊」的戰術，提出「三分軍事，七分政治」的口號，軍事、政治、經濟「三管齊下」。
在軍事上，國民黨軍集中兵力於巖、永、杭地區，實行所謂重點「清剿」。戰術上實行「駐剿」、「搜剿」、「堵剿」相結合，以「駐剿」為主的方法，企圖在整個遊擊區布下羅網，陷紅軍遊擊隊於絕境。
在政治上，強化反動統治。其中「連坐法」和「移民並村」是最為狠毒的兩種。
「連坐法」就是一戶違反當局禁令，十戶以至整個村莊的人將被殘殺。
「移民並村」則是強迫各小山村群眾遷居到大集鎮，制造無人區，企圖割斷紅軍遊擊隊與群眾的聯系。
此外，國民黨還實行自首政策，頒發所謂「自首自新條例」，引誘紅軍遊擊隊中的動搖分子投降變節。
在經濟上，國民黨強制實行計口售糧、計口售鹽，禁止外出勞動的群眾多帶糧食，斷絕紅軍的糧油食鹽，以扼殺紅軍的生路。
盡管國民黨軍「清剿」手段極端毒辣，鬥爭異常殘酷，但閩西南紅軍遊擊隊沒有被嚇到，依然堅持開展遊擊戰爭。
在巖連寧地區，國民黨軍在龍巖之白沙、雁石、溪口各駐紮1個團，分路進攻第一作戰分區的遊擊基地大羅坪、天官山、赤高坪和焦營坑等鄉村。
方方、羅忠毅等決定乘敵人平均使用兵力和盲目行動的機會，留少數兵力在內線鉗制敵人，主力則轉入敵軍背後開展活動。
但不到10天，國民黨軍就發覺了紅軍遊擊隊的這一部署，立刻掉頭回來，更加瘋狂地追襲紅軍遊擊隊。
第一作戰分區的紅軍沒有料到敵人來得這麽快，缺乏必要的準備，在極其困難的條件下頑強與敵人戰鬥2個月，受到了重大損失，明光獨立營營長賀萬德犧牲。
1936年3月，第一作戰分區為保存力量，將部隊分成 4股，每股四五十人，在周圍各縣毗鄰地區打擊最反動的分子，幫助返鄉移民重整家園，度過了最為艱苦的一年。
第二作戰分區的紅九團一部繼續在閩南縱橫馳騁打擊敵人，並在閩粵邊境各縣發動群眾打土豪分田地，建立紅色政權。
但是，由於紅九團經常集中兵力打擊國民黨正規軍和民團，引起敵人重視。1936年1月，國民黨軍調集第十師和粵軍第155、157兩個師，在廣東饒平、大埔和福建平胡邊境圍攻紅九團。
紅九團一部撤出平胡，向永定東部老遊擊區轉移。由於部隊集中行動，目標暴露，在永定湖雷一帶遭到國民黨軍第十師包圍襲擊，部隊傷亡很大，紅九團政治部主任賴榮傳犧牲。
在極其困難的情況下，紅九團積極收容和整頓部隊，組成特務大隊，重回老遊擊根據地開展遊擊戰爭。在官山消滅國民黨軍第八十師1個排，繳獲一批武器彈藥，隨後又巧襲永定三萊州，全殲了國民黨1個保安團，從而擺脫了被動局面，獲得了新的發展。
活動在第三作戰分區的紅八團集中在朗車進行短期整訓，總結經驗教訓後，決定以分散遊擊為主，以連排為作戰單位，采取更加靈活的戰術。
1936年3月初，紅八團決定在分散之前向漳平、華安邊境開進，深入敵區作短期活動，以擴大政治影響，解決部隊給養。但這時，國民黨軍第十師1個旅已向朗車進攻，華安方向國民黨軍也已增加兵力，布防就緒。
紅八團行至漳平縣邊境梅營村，與敵人發生激戰，團政委邱織雲不幸犧牲。
團長邱金聲和接替政委職務的伍洪祥根據敵情變化，立刻率領部隊轉移，經過幾天緊急行動和激烈戰鬥，擺脫了敵人的追擊，然後按照朗車整訓時的原定部署，將全團5個連分散在漳龍公路兩側和永定東部，積極地開展反「清剿」鬥爭。
紅八團分散活動時，國民黨軍大肆散布紅軍遊擊隊已被「剿滅」的謠言，第十師師長李默庵打算在龍巖城召開「剿匪」祝捷大會，並大擺慶功宴，宴請第十師營以上軍官和參戰民團首領。
為打擊敵人的氣焰，粉碎其謊言，邱金聲率1個短槍隊，在李默庵舉辦慶功宴的當晚，夜襲龍巖國民黨陸軍第十三醫院，繳獲大量藥品。
邱金聲還在醫院打電話給正在吃飯喝酒的李默庵，警告他：「你不要吹牛，小心我們取你性命。」
1936年3月底，紅八團得知駐龍巖崎獺之國民黨軍第十師補充團第三營主力外出，立即集中一部兵力與龍巖地方遊擊隊，乘虛襲擊該營部，全殲守敵1個排，擊斃其正副營長。
為了瓦解敵人的保甲制度和壯丁隊，紅軍遊擊隊運用「白皮紅心」的小股遊擊隊在各地行動，這些遊擊隊短小精幹，到處打擊敵人。
1936年上半年，在紅軍和各縣遊擊隊不斷勝利的鼓舞下，群眾鬥爭也開始活躍。他們采取合法鬥爭與非法鬥爭相結合，武裝鬥爭與非武裝鬥爭相結合，有力地配合了紅軍遊擊隊的活動。
如龍巖後田，童養媳出身的張溪兜組織群眾運用各種形式，拖延國民黨軍修築炮樓的工程，並在後田建立了秘密聯絡點和被服廠，後田村實際成了紅軍遊擊隊的後勤補給站。
壟丘坑婦女陳客娜為支援紅軍遊擊隊，兩次被抓，受盡酷刑，但她始終堅貞不屈，直到被國民黨軍殘醋殺害。
正是由於無數革命群眾冒死援助和支持，閩西南紅軍遊擊隊才得以在難以想像的艱苦環境中堅持鬥爭，直至勝利。 1936年春，閩西南紅軍遊擊隊經受了嚴峻的考驗，有效地打擊了敵人，保存了自己，在閩西南地區10多個縣建立了四大塊遊擊根據地。
到1936年夏，閩西南的局面逐漸好轉，群眾的情緒趨於穩定。革命武裝力量，除了紅八團、紅九團和明光獨立營外，永定、上杭、龍巖等縣都有百余人的遊擊隊，還組建了許多遊擊小組。
在黨的組織方面，恢復了各級組織系統，縣以下建立了區委，有不少鄉村建立了黨支部。
各縣之間還建立了武裝交通隊，形成了一個交通網，把整個閩西南遊擊區聯系起來，保障了閩西南軍政委員的統一領導和指揮。
1936年7月，閩西南軍政委員會召開會議，以紅八團、紅九團為基幹，將閩西南的紅軍遊擊隊整編為6個支隊；
第一支隊支隊長邱立生，政委陳得清；第二支隊支隊長李角旺，政委昊作球；第三支隊支隊長闕樹槐，政委邱成賢；第四支隊支隊長阮文松，政委李赤標；第五支隊支隊長劉永生，政委熊夢輝；第七支隊支隊長劉憲，政委黃火星。
1936年9月，國民黨在閩西南地區仍集中第三師、第八十師、第五十二師、第三十七旅，以巖永杭為中心，對紅軍遊擊隊發動第三次「清剿」。
在「清剿」中，國民黨軍故伎重演，強迫移民，燒房搜山，限制糧食，嚴密保甲制度。閩西南紅軍遊擊隊運用遊擊戰術，看準時機堅決打擊敵人的進攻。
10月9日，紅三支隊與龍巖獨立營協同作戰，在白土殲滅國民黨軍第三十七旅1個連及當地民團近100人，擊斃國民黨福建省土地督察員。
3天後，紅三支隊與龍巖獨立營在東坑、巖山頭設伏，再次打退國民黨軍第八十師1個團的進攻，打死打傷敵100余人。
在此前後，紅一支隊在巖連寧邊區消滅國民黨軍第五十二師1個加強連，隨即又攻占龍巖之溪口、塗潭，消滅地主武裝 200余人和駐守在銅缽山後的第三師1個排。
國民黨軍在受到連續打擊以後，不敢再貿然出動，各區鄉民團更是縮到碉堡中不敢下鄉。
1936年6月上旬，爆發了以陳濟棠、李宗仁為首的粵系和桂系軍閥反對蔣介石統治的西南事變（亦稱兩廣事變）。
蔣介石在平息了兩廣事變之後，重又回師對付南方各省紅軍遊擊隊。10月間，駐閩綏靖主任蔣鼎文由廣東重返漳州，著手布置對閩西南的第四次「清剿」。
10月28日，蔣鼎文及其駐閩綏靖主任公署由漳州北遷建甌。駐防閩西南地區的中央軍各部也相繼北調。閩西南的防務改由粵軍第一五七師、一五八師接替。
這樣，由蔣鼎文一手部署的第四次「清剿」計劃，因國民黨軍的換防，未得全面實施。
1936年11月上旬，粵軍分批抵達閩西南，以第一五七師1個旅駐龍巖、漳平邊界，第一五八師1個旅駐龍巖、永定邊界，另有2個團駐上杭、連城一線。
1937年1月，粵軍對閩西南遊擊區發動了第五次「清剿」。軍事上采用分進合擊戰術，埋伏襲擊紅軍遊擊隊，破壞閩西南黨後方機關及地方工作。
同時，實行經濟封鎖，強迫群眾倒伐樹木移民並村，築堡做柵，扶植地主武裝，利用叛徒屠殺革命群眾等等，無所不用其極。
閩西南軍政委員會分散遊擊。一方面開展靈活的遊擊戰爭，在軍事上打擊粵軍，另一方面發動社會人士，反對粵軍燒山移民、淪陷閩西南經濟的殘暴行徑，並對粵軍大力宣傳「停止內戰共同抗日」的主張。
由於措施得當，粵軍在政治上、軍事上很快陷於被動。到1937年3月，粵軍初進閩西時那種傲慢兇殘的氣勢逐漸低落，第五次「清剿」隨之結束。
至 1937年3、4月間，閩西南遊擊武裝約3000余人，黨的組織有8個縣委、56個區委、400多個支部，擁有黨員3000余人。
1937年4月，方方受閩西南軍政委員會委托，前往延安匯報工作。在延安期間主席方方說：「你們堅持了三年遊擊戰爭，保留了這麽多幹部，保留和發展了部隊，保留了20萬畝土地，保衛了蘇區廣大群眾利益，這是偉大的勝利。」
1938年8月，閩西南遊擊隊改編為新四軍第二支隊，隨即奔赴抗日的戰場。
